Les URAWA REDS sont donc les nouveaux champions de football pour 2006. C'est le premier titre majeur pour cette équipe. Elle a finalisé son année par une magnifique victoire 3-2 sur les champions de l'année précédente les Gamba Osaka. Ces derniers terminent même troisième en se faisant souffler la deuxième place. L'entraineur Allemand Buchwald des Reds à la suite de sa victoire a décidé de retourner en Allemagne pour passer plus de temps avec sa famille. En bas de classement, Kyoto Purple Sanga est relégué, Cerezo Osaka est relégué. Avispa Fukuoka devra faire en sorte de gagner un barrage contre Vissel pour rester parmi l'élite. Yokohama FC et Reysol montent en J1.
| Omiya |
2 0 |
C-Osaka |
| F-Tokyo |
0 0 |
Urawa |
| Kawasaki-F |
3 2 |
Kashima |
| Yokohama F¥M |
0 1 |
Oita |
| Kofu |
2 3 |
Chiba |
| Iwata |
1 0 |
Shimizu |
| Nagoya |
2 0 |
Fukuoka |
| G-Osaka |
3 2 |
Kyoto |
| Hiroshima |
2 1 |
Niigata |
|
|
|
|
|
|
|
|
|
| Kashima |
3 0 |
Iwata |
| Urawa |
3 2 |
G-Osaka |
| Chiba |
0 2 |
Yokohama F¥M |
| Niigata |
1 2 |
Omiya |
| Shimizu |
3 0 |
Hiroshima |
| Kyoto |
0 1 |
Nagoya |
| C-Osaka |
1 3 |
Kawasaki-F |
| Fukuoka |
1 1 |
Kofu |
| Oita |
0 1 |
F-Tokyo |